1895年清朝與日本爆發甲午戰爭失敗，訂立「馬關條約」，台灣被迫割讓于日本，當年6月17日，第一任台灣總督樺山資紀舉行總督府始政典禮，台灣成為日本的殖民地。

    後藤新平(1857年7月24日～1929年4月13日)於明治23年(1890)赴德國留學，二年後回日本出任內務省衛生局長，明治31年(1898) 2月來台擔任第四任總督兒玉源太郎的民政長官，因兒玉經常不在台灣，後藤新平獲得信任，以民政長官的身份代為處理台灣總督府的各項政務等同於有實無名的總督。他的目標是將台灣改造成「模範殖民地」。

    後藤於擔任民政長官任內，治台策略為依據「生物學」的原則，有計劃的進行土地調查、戶口普查、風俗慣習調查，促進科學發展與農、工、衛生、教育、交通、治安等，並招撫抗日份子，攏絡仕紳，進而奠定日本在台灣的統治基礎。

    產業方面，後藤先將原有的糖業基礎引進新式技術與資金，促成台灣糖業的蓬勃發展。其任內並全力推動鐵、公路、海港等交通建設，今天仍持續營運的台灣南北縱貫鐵路與成為觀光路線的阿里山森林鐵路均是後藤當年完成及主導興建的。

    後藤在台時間共八年又八個月，離開台灣後任「南滿洲鐵道株式會社」總裁，日後並在日本政、學界歷任要職。

    後藤新平文書記錄了後藤生平重要的事蹟，也記錄了重要的歷史事件，是研究者珍貴的第一手研究資源。文件依後藤新平生平為序共33輯，包含書冊類、公文類、報章雜誌類、電報類及郵件類等共3521件檔案文獻。

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